育秧盤是幼苗生長發育的場所而基質則是為幼苗提供營養來源的主要供應場所是穴盤的主要來源。育苗基質的基本要求工廠化育苗的基本基質材料有珍珠巖、草炭(泥炭)、蛭石等。國際上常用草炭和蛭石各半的混合基質育苗，我國一些地區就地取材，選用輕型基質與部分園土混合，再加適量的復合肥配置成育苗基質。但機械化自動化育苗的基質不能加田土。

    穴盤育苗基質的總體要求是盡可能使幼苗在水分、氧氣、溫度和養分供應得到滿足。影響育苗基質理化性狀主要有：基質的pH值、基質的陽離子交換量與緩沖性能、基質的總孔隙度等。有機基質的分解程度直接關系到基質的容重、總孔隙度以及吸附性與緩沖性，分解程度越高，容重越大，總孔隙度越小，一般以中等分解程度的基質為好。

    不同基質的pH值各不相同，泥炭的pH值為4.0～6.6，蛭石的pH值為7.7，珍珠巖的pH值為7.0左右，多數蔬菜、花卉幼苗要求的pH值為微酸至中性。陽離子交換量是物質的有機與無機膠體所吸附的可交換的陽離子總量，高位泥炭的陽離子交換量為1400～1600mmol/千克，淺位泥炭為700～800mmol/千克，腐殖質為1500～5000mmol/千克，蛭石為1000～1500mmol/千克，珍珠巖為15mmol/千克，沙為10～50mmol/千克。